Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zic1P46684 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zic1P46684 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zic1P46684 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms