Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx2-2P42586 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx2-2P42586 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms