Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighmbp2P40694 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighmbp2P40694 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms