Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TfamP40630 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TfamP40630 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TfamP40630 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TfamP40630 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TfamP40630 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TfamP40630 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TfamP40630 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TfamP40630 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TfamP40630 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TfamP40630 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms