Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VhlP40338 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VhlP40338 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VhlP40338 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VhlP40338 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VhlP40338 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
VhlP40338 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
VhlP40338 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VhlP40338 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VhlP40338 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VhlP40338 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VhlP40338 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VhlP40338 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VhlP40338 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VhlP40338 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VhlP40338 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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