Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn1P35821 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptpn1P35821 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms