Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddit3P35639 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms