Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr2cP34968 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr2cP34968 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr2cP34968 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr2cP34968 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr2cP34968 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr2cP34968 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Htr2cP34968 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Htr2cP34968 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms