Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nedd1P33215 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nedd1P33215 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms