Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxa10P31310 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms