Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd28P31041 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd28P31041 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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