Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msr1P30204 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msr1P30204 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msr1P30204 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms