Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp1P29452 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms