Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mmp3P28862 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms