Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PtprmP28828 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprmP28828 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
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