Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CebpbP28033 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CebpbP28033 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms