Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vav1P27870 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms