Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpbP27790 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpbP27790 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms