Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg3P27681 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg3P27681 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms