Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CftrP26361 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CftrP26361 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CftrP26361 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CftrP26361 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CftrP26361 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CftrP26361 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CftrP26361 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CftrP26361 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CftrP26361 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CftrP26361 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CftrP26361 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CftrP26361 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CftrP26361 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CftrP26361 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CftrP26361 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CftrP26361 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CftrP26361 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CftrP26361 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CftrP26361 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CftrP26361 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CftrP26361 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CftrP26361 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CftrP26361 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CftrP26361 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CftrP26361 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CftrP26361 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CftrP26361 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CftrP26361 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CftrP26361 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CftrP26361 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CftrP26361 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CftrP26361 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CftrP26361 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CftrP26361 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CftrP26361 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CftrP26361 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CftrP26361 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CftrP26361 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CftrP26361 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CftrP26361 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CftrP26361 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CftrP26361 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CftrP26361 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms