Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChgaP26339 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChgaP26339 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChgaP26339 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms