Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna1P26231 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms