Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk11bP24788 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk11bP24788 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms