Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr3aP23979 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr3aP23979 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr3aP23979 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Htr3aP23979 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms