Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZfaP23607 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZfaP23607 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZfaP23607 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms