Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd8P23463 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms