Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gja1P23242 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms