Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cst3P21460 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cst3P21460 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms