Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BdnfP21237 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BdnfP21237 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BdnfP21237 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms