Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnc2P20801 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnc2P20801 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms