Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P20040 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P20040 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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P20040 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P20040 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P20040 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P20040 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P20040 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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