Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ms4a1P19437 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms