Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NelfeP19426 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NelfeP19426 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms