Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csn1s1P19228 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csn1s1P19228 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms