Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ifrd1P19182 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifrd1P19182 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms