Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps6ka3P18654 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms