Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PcnaP17918 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PcnaP17918 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms