Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmga1P17095 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmga1P17095 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms