Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sptan1P16546 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sptan1P16546 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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