Protein–RNA interactions for Protein: P15973

Phxr1, Putative per-hexamer repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phxr1P15973 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phxr1P15973 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phxr1P15973 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms