Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prph2P15499 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prph2P15499 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prph2P15499 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms