Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrphP15331 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrphP15331 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrphP15331 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrphP15331 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrphP15331 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrphP15331 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrphP15331 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrphP15331 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrphP15331 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrphP15331 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrphP15331 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrphP15331 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrphP15331 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrphP15331 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms