Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd1P13516 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd1P13516 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms