Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Vpreb2P13373 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms