Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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OtcP11725 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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OtcP11725 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtcP11725 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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OtcP11725 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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OtcP11725 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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OtcP11725 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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OtcP11725 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtcP11725 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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OtcP11725 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtcP11725 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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OtcP11725 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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OtcP11725 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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OtcP11725 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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OtcP11725 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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OtcP11725 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtcP11725 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtcP11725 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtcP11725 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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OtcP11725 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtcP11725 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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