Protein–RNA interactions for Protein: P11680

Cfp, Properdin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfpP11680 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfpP11680 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CfpP11680 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CfpP11680 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CfpP11680 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CfpP11680 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CfpP11680 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CfpP11680 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfpP11680 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms