Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP11369 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP11369 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP11369 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP11369 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP11369 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP11369 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP11369 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PolP11369 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PolP11369 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PolP11369 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PolP11369 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PolP11369 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PolP11369 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PolP11369 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PolP11369 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PolP11369 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PolP11369 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PolP11369 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PolP11369 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PolP11369 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms