Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nid1P10493 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms