Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh3P10287 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh3P10287 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms