Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb4P10284 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb4P10284 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms